安诺优达携手中科院遗传所召开基因组学前沿技术应用研讨会

　　2020年12月5日，在中国科学院遗传与发育生物学研究所肖军研究员的大力促成及鼎力支持下，中国科学院遗传与发育生物学研究所和安诺优达生命科学研究院联合筹办的基因组学前沿技术应用研讨会在北京完美落幕。在疫情防控形式下，为了让更多对基因组学感兴趣的科研人员能够同步学习到各位报告嘉宾的科研成果，本次会议以线下会议和线上直播的形式进行。

　　会议由中国科学院遗传与发育生物学研究所副所长黄勋研究员和安诺优达基因科技(北京)有限公司总经理田佳先生热情的开幕词拉开序幕。本次会议引人瞩目， 由13位专家围绕基因组进化和多倍化、趋同和适应性化、协同进化、转录调控、表观修饰调控等基因组学研究方向就最新研究进展及经验、技术突破、应用展望进行了专题报告。

　　嘉宾报告精彩回顾

　　浙江大学张亮生教授以“花卉基因组与开花植物的进化”为题分享了蓝星睡莲基因组研究成果，揭示了早期被子植物进化特点及特征，解析了睡莲的花香及花色合成途径，对园艺植物分子育种具重要参考价值。

　　西湖大学的李小波研究员，以“Understanding photosynthetic energy metabolism using high-throughput genetic tools”为主题分享了以单细胞藻类为模式系统探究了光合能量代谢过程中所涉及的分子成分及其相关的调控和进化机制。

　　中科院植物研究所焦远年研究员以“Whole genome duplications and plant adaptive evolution”为主题分享了植物多倍化的起源研究和近期的研究成果，发现了植物进化过程中一些难以被发现的古基因组加倍事件。基于对加倍进化历程中保留基因的分析基础上，探讨了植物多倍化的进化意义，进一步说明了物种进化过程中的趋势。

　　中国科学院遗传与发育生物学研究所的鲁非研究员以“Adaptive evolution of wheat: convergence within divergence” 为题主要分享了小麦不同来源染色体亚型进化历程和遗传多样性。通过构建小麦全基因组遗传图谱以及基因渗入分析，为小麦的育种和科研提供了重要的分子基础，并且揭示了AB和D亚基因组的遗传多样性差异。

　　广西大学的刘庆友研究员以“水牛种质资源与多组学研究”为题，为大家分享了中国沼泽型水牛和印度河流型摩拉水牛的参考基因组所取得的重要研究成果，发现沼泽型水牛OXTR基因及其所属的的催产素通路(Oxytocin signaling pathway)受到选择性富集，推测可能是稻田耕作中牛响应人类命令的结果。同时，还结合比较转录组、比较蛋白质组等手段对水牛产奶性状、肉质性状形成的遗传基础进行了系统解析。

　　中国科学院遗传与发育生物学研究所李响研究员以单细胞DNA甲基化测序的那些事儿为主题分享了自己近期在单细胞甲基化领域所做的一些尝试及其相关研究成果，围绕自主开发scBRIF-seq方法展开了详细阐述，为单细胞甲基化的研究提供了新的建库测序和分析方法。

　　中国农业科学院(深圳)基因组研究所的张兴坦研究员以基因组学研究揭示榕树进化之谜为题分享了近期在榕树基因组中所取得的重要研究成果：通过比较基因组、群体遗传学、转录组和代谢组等组学研究，揭示了榕树气生根发育、性别决定的未解之谜，并在基因组水平上揭示了榕树-榕小蜂在形态和生理方面的协同演化对双方类群的协同多样化的重要影响。

　　作物性状改良的基础是对决定性状形成的遗传基础进行解析。其中，决定器官分化的基因的时空特异性表达的调控元件的分离以及调控网络的构建是未来作物改良的基础。在这次会议上，华中农业大学鄢文豪教授以“基因转录调控与精准育种”为题，重点围绕调控元件动态图谱和转录因子网络构建进行详细的介绍。

　　中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所徐炜研究员以"R-loop测序技术开发与应用"为题进行了分享，基于单链 DNA 连接技术，开发了稳定可靠且提供 R-loop 链特异性信息的全基因组 R-loop 检测方法——ssDRIP-seq，为DNA的转录研究提供了很好的研究思路，通过研究发现RNA的m6A 修饰是通过影响R-loop的结构，来调控基因转录的终止过程。

　　北京大学周岳研究员以"H2AK121ub in Arabidopsis associates with a less accessible chromatin state at transcriptional regulation hotspots"为题分享了通过整合不同拟南芥中PcG突变体的染色质可及性、组蛋白标记和表达分析，证实了PcG活性的丧失导致了染色质可及性的增加，但这并不一定伴随着转录激活，表明了可及性染色质并不总是预测基因表达。

　　南京大学陈迪俊副教授以“ChIP-Hub: an integrative platform for exploring plant regulome”为题，围绕自主开发的ChIP-Hub调控组学大数据平台进行了详细的阐述，利用ChIP-Hub探索了超过40种植物的8000多个ChIP-seq相关数据集并进行全面的重新分析和比较，同时，他指出了利用这一资源将允许来自不同领域的生物学家全面使用所有可用的调控基因组信息，以获得更多针对其特定问题的新见解。

　　安诺优达的生物信息中心总监刘涛博士以“三代测序技术助力多组学研究进入新时代”为主题，分享了三代测序在各个组学上的应用以及安诺优达在这些应用上的优化。随后通过对Pacbio数据的比对分析，展示了安诺优达三代多组学数据应用方向进行的数据利用率、检测效果、资源消耗等问题上的优化，表明其将更好、更高效服务于科研工作者的三代测序多组学研究。

　　每场报告的结尾都有雷鸣般的掌声，每一个热烈的掌声都是对嘉宾和报告内容的最直接，最诚挚的认同和赞叹。

　　结束了精彩纷呈的报告环节，各位专家学者围绕以下四个主题进行了圆桌讨论：1)多倍体和二倍体材料在基因组研究方面的异同是什么? 2)针对复杂基因组中存在大量重复，高杂合的区域，能否用新的技术手段及分析策略提升组装质量;3)未来测序技术在基因组学研究中有望取得哪些突破; 4)农业基因组研究领域的发展趋势和方向等。在讨论中，专家学者自由发言，理性而科学的想象使讨论极为生动有趣。同时，也为大家提出了许多宝贵的建议，受益匪浅。

　　至此，在各专家和与会嘉宾的大力支持和积极参与下，本次研讨会圆满落幕。再次衷心感谢中国科学院遗传与发育生物学研究所的研究员肖军对这次会议的协助。错过在线直播和现场出席但对会议报告感兴趣的师生不要遗憾。我们将会在征得嘉宾同意的基础上，将报告剪辑整理分享到网上，更多信息可关注-微-信-公-众-号-信息和-微-信-交-流-群-消息。